在《生化奇兵》这款游戏中，虽然主角经常使用的进攻武器是长剑，但很多时候扳手这种工具的作用要比它更厉害，利用它可以找到许多破坏力超强的作战工具。更有趣的是，电流门闩长时间摩擦能够产生火花。此外，新作总共有5种不同特色的武器类型，都是主角经常使用的基本攻击武器。譬如其中有便携式手枪，霰弹猎枪和远距离步枪等种类。同大家所玩过的第一人称射击游戏相比，本作允许玩家一直使用多种不同新武器进行探险。更有吸引力的是还可以升级手中的武器，例如步枪升级成狙击步枪，它的攻击力和精确度都会大大提高。当然了，其他武器升级后也一样会变得更加可怕。